Sotto il profilo istituzionale e organizzativo, l’Università degli Studi di Cagliari è articolata in quattro aree: Organi accademici, Direzioni operative, Unità di staff e altri organi.

La struttura organizzativa prevede come organi di governo il Rettore, i Prorettori e delegati, il Senato accademico e il Consiglio di amministrazione.